Vědečtí a akademičtí pracovníci FTVS UK se účastní celé řady odborných konferencí a workshopů po celém světě, zároveň se fakulta snaží přispívat k rozšíření poznání v oblastech sportovních, zdravotních a ostatních příbuzných věd pořádáním vlastních konferencí.

Jedná se o dvě již tradiční domácí konference. Především na studenty a doktorandy je zaměřena konference SCIENTIA MOVENS, která má tradici již téměř tři desítky let. Konference Zdravotní tělesná výchova oslavila v roce 2025 pětileté výročí.